Bonsoir,
Le terme "un mètre d'eau" est peut-être excessif, une hauteur plus faible peut être à l'origine d'une aspiration d'eau...
Une analyse d'huile (dans un laboratoire indépendant, pas de pétrolier!), de la culasse et des cylindrées peut permettre de mettre en évidence un moteur ayant avalé de l'eau.
Quoi qu'il en soit si vous n'êtes pas d'accord avec la version de votre réparateur ne demandez pas de travaux et faites intervenir un expert indépendant, c'est malheureusement le seul moyen de trancher. C'est ce dernier qui fera demander les travaux qu'il jugera nécessaires pour identifier l'origine du problème.
Plus tôt il interviendra plus simple ce sera à régler puisque tout sera encore dans son jus, les éléments n'auront pas été (trop) modifiés.